在建設實驗室的同時，除了要考慮實驗室的實驗室家具、實驗室設備以及通風系統之外，實驗室的給水排水系統也是尤為重要的，實驗室的凡是有毒有害物質的污水，必須要進行處理，符合國家排放標準之后，方可進行排水。不能功能類型的實驗室實驗室的給水排水工程設計也是不一樣的。
一、普通實驗室的給水排水
（1）給水
在進行實驗室的給水系統設計的時候，水量、水質和水壓都要保證足夠，除了實驗和日常的基本用水以為，還要考慮和配置相應的消防設備的給水。對于高層實驗室，若室外的給水官網不能充分滿足其高層用水需求或者水壓存在經常或周期性不足的時候，為確保高層實驗室的安全供水，應該設置屋頂水泵、水箱或者局部加壓設備，甚至在進水口進行斷流水池的設置。
普通實驗室的用水，通常設置一根引入管就可以，但如果大型實驗樓的消防栓數量較多或者實驗的設備需要安全供水，就應該設置兩根引入管。
單根引入管通常從建筑物的中部引入，進入實驗樓，這樣水壓就較為平衡。若是兩根引入管，通常從實驗樓的不同側引入。如遇特殊情況，只能從同一側進入，就應該保證引入管之間有較大的間距，距離不能低于10米，同時連接兩個引入管的給水管網應該設置閥門，以保障在局部出現故障時仍然能夠安全供水。引入管則應從用水量較大的地點引入。
另外，實驗室內部給水管道要能夠布置合理，這樣就便于管道的維護。內部的管道線盡可能地短，同時避免交叉，以使供水更加安全、可靠。普通實驗室管道通常是沿著走道、墻壁、天棚或柱角等位置，走明線，方便觀察，但是及易積累灰塵。因此，在安全要求比較高的實驗室中通常盡可能進行暗裝，將管道敷設在地下室、天棚、管溝或公用管廊內部。值得注意的是，所有的暗設管道都應該在控制閥門的位置設置相應的檢修孔，以方便故障維修。
生活供水管道常常設置在潔凈區。射性實驗室的給水系統管道入口，其給水管網常常采用上行下給式，也設置于干凈區，以避免擴散污染。管道從潔凈區接到受污區的設備，如衛生通過間、手套箱、通風柜、淋浴器等處所時，均有可能受污，因此，應該由局部斷流水箱來送入。斷流水箱的容量和高度要適當，必要時還應該增設加壓裝置。也可以在不同的放射水平的交接位置，用斷流閥門在管道的兩端各設一個斷流閥門，并在其中間接上支管一根，在管道不工作的時候，關閉斷流閥門并打開泄放閥門，以便將余水放空。而小型放射性化學實驗室，可以在進入受污區之前，在管道上設置一個逆止閥，以防止受污。
此外，應在放射化學實驗室受污區設置灑水龍頭，用來清洗受污表面。灑水栓流量通常采取管徑25毫米，水流0.7升/秒，自由水頭10米。各個灑水栓的間距設置為20到25米，在使用的時候可以接橡皮管，其長度為10到15米。可以在高放射水平場所的衛生通過間內，用大管徑，入1%到2%濃度的蘇打水，設蘇打水管，通常水溫控制在35到40度之間，溫度太低容易造成管道堵塞。
（2）排水
實驗室排水系統應該根據相應的排出廢水的性質、成份和受污程度來進行設置。有害物質的排放要符合相應的國家標準，因此，對于有害物質要先進行一定的處理才可排出。甚至要設置獨立排水的管道進行局部處理，方可排入室外的排水管網。而對于一些含有無害的膠狀物體、懸浮物體或設備冷卻水，因其受污并不嚴重，可以直接排放到室外的排水管網。但是，如果這些廢水要進行重復使用的話，則要進行相應的處理。
排水管道的設置同樣需要進行合理的布局，轉角盡量少，以防止雜質堵塞，在安排上要相對集中，這樣就便于出現故障后的維修。排管時要盡量沿著走道、柱角、墻壁、天棚等，但要注意，避免穿過精密儀器室等衛生安全需求較高的實驗室。主管道應盡量安排在靠近雜質較多、排水量較大的設備的位置。
放射性廢水的排放，要按照其化學性質和其放射性水平分流排出，同時要進行一定的處理。廢水量不大的小型實驗室可采用一個排水系統。
但是廢水量雖小但是濃度卻較高，則可用專門的容器進行收集，送往廢水貯存處或進行相應的處理。排出的放射性廢水不可貫通潔凈區，而應由潔凈區向受污區排流，避免擴散污染。如果放射性水平較高的話，就要設置專用的排水管溝、豎井、管槽，同時采取必要的防護措施。如果放射性廢水有腐蝕性，則一定要選用恰當的耐腐蝕材料來制作管料，避免腐蝕泄露。—般而言，管溝可以用磚砌筑，若需要防護或地下水位較高就需要用混凝土砌建。管溝的覆面則用水泥抹面，碳鋼或不銹鋼復面，同時刷防銹漆。
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